Akwarium Gdyńskie to nietypowy ogród zoologiczny – wszyscy podopieczni związani są ze środowiskiem wodnym, a cała powierzchnia zamknięta jest w bryle jednego budynku. W ponad 130 tonach wody żyją tu ryby, płazy i gady z różnych rejonów świata. Ekspozycja podzielona jest tematycznie: W Sali Rafy Koralowej prezentowani są barwni lokatorzy „żywej skały”. Przestrzeń Wodnych Zwierząt Świata zamieszkują organizmy z zimnych głębi wszechoceanu. W Sali Na Styku Wody i Lądu spotkać można zwierzęta z pogranicza tych dwóch światów, a Sala Amazonii odzwierciedla naturalne środowisko części Ameryki Południowej. Bałtykowi i pobliskiej Zatoki Puckiej Wewnętrznej poświęcona jest przestrzeń dwóch sal, a najstarsza część ekspozycji - Sala Dydaktyczna, prezentuje m.in. unikatowe egzemplarze ogromnych żółwi wodnych.